в чем вы видите принципиальальное различие в значении спор у грибов и у бактерий

Споры бактерий выполняют защитную функцию, не выполняют функцию размножения, имеют плотные оболочки, обеспечивают распространение.
Споры грибов - основная функция - размножение, имеют менее плотную оболочку,по сравнению со спорами бактерий.