1. У инфузории 2 ядра (малое и большое) . У амебы одно.
2. У инфузории постоянная форма тела. У амёбы непостоянная, вечно переливающаяся
3. Передвигаются инфузории ресничками, амёбы - ложноножками.
4. У инфузории две сократительные вакуоли, у амёбы - одна
5. Инфузория туфелька размножается половым и бесполым путём. Амёба только бесполым.
6. У инфузории есть ротовое отверстие, у амёбы его нет.
7. У инфузории имеется порошица, у амёбы нет.
8. Инфузория защищена от окружающей среды, она покрыта пелликулой, амёба покрыта только мембраной.
9. У инфузории имеется глотка, у амёб её нет.
10. У инфузории имеется трихоциста (для нападения и защиты), у амёбы нет её.