Атом водорода - это, фактически и есть протон с одним
электроном. Поскольку масса электрона ничтожно мала по сравнению с массой
протона, то фактически масса атома водорода - это и есть масса протона. Вполне
естественно, что массу всех других атомов решили сравнивать с массой самого
маленького из них - массой атома водорода. Если строгое определение, то, да,
там, насколько я помню, единица определяется именно как 1/12 массы атома
углерода. Но, в принципе, для простоты можно считать, что а. е. м. (атомная
единица массы) - это масса атома водорода, и относительная атомная масса
выражены в этих единицах. А атомная масса - это просто масса атома, выраженная
в обычных единицах массы, килограммах, например.