Начните с выделения управляющей идеи в самых-самых простых произведениях. Например (нет, я не шучу) в детских сказках. Какова основная идея сказки о Колобке? А о трёх поросятах? Это нетрудно — дети ведь ощущают её интуитивно, для того им сказки вместо прямых моралей и читают. Но вы попробуйте сформулировать. Скажем, управляющая идея сказки о Колобке: "попытки полностью оторваться от социума и стать абсолютно самодостаточным не приведут к хорошему, даже если поначалу всё будет идти здорово". Попробуйте с другими.
Когда научитесь делать так со сказками, переходите к самым простым на смысловом уровне произведениям для взрослых. Например, пересмотрите для этого фильмографию Шварценеггера: там почти всегда есть чёткая, очень понятная управляющая идея. Потому что сценарии писали пускай простые, "под попкорн", но профессионально. Сейчас в блокбастерах с этим сложнее стало, не всегда автор сам понимает, о чём писал...
И так вы постепенно научитесь понимать разные смысловые уровни, разбирать тонкие, глубоко метафоричные высказывания. Это такая же тренировка навыка, как в любом другом деле: всё идёт от простого к сложному. Сначала учитесь анализировать примитивное, потом всё более и более запутанное и тонкое. Чтобы рационально анализировать текст, надо иметь в голове отлаженный аналитический аппарат, и он — как в классическом фильме, "достигается упражнением".
Конечно, я сейчас про сухой научный подход. Можно много говорить о том, как "чувствовать" литературу, да только этому научить не получится. Это уж или получается, или нет... А вот научный метод применить можно вполне осознанно.