известно,что чем больше скорость движения молекул тела,тем выше его температура.Почему же не нагревается пулька,выстрелянная в тире из пневматического ружья,хотя все молекулы движутся к мишени с большой скоростью?

Вообще говоря, нагревается))) правда не очень заметно. Есть сила сопротивления воздуха. По этой причине, скажем, сгарает космические камни ("звездопад") в атмосфере.
Но температура характеризуется "внутренней" кинетической энергией тела, т.е. средней кинетической энергией в системе центра масс тела. а в системе центра масс пули, скорость молекул (!средняя!) заметно не меняется.