Общее лексическое значение этих слов связано с пальцами.
Перчатки - то, что надевают на пальцы рук, спасая их от холода или травм.
Наперсток - приспособление для шитья иголкой, предотвращающее травму пальца или помогающее продевать иглу сквозь плотную ткань. Обычно надевается на первую фалангу среднего пальца.
И в том, и в другом случае эти предметы надеваются на руку, а именно на пальцы.