Редкие и исчезающие растения Казахстана подлежат специальной охране. В республике их около 600 видов, значительная часть их включена в Красную книгу РК.
Это 287 - цветковых - рафидофитон, таволгоцвет, пастернаковник, недзвецкия, канкриниелла, дорема каратауская, ферула сюгатинская, полынь цитварная и др. В Красной книге 2 вида голосеменных (стланиковая форма ели Шренка, можжевельник зеравшанский) ; 3 вида папоротникообразных (щитовник мынжилкинский, адиантум, венерин волос) ; 3 вида мхов (сфагнум гладкий, пахифиссинденс крупнолиственный, ортотрихум приглаженный) ; 1 вид лишайников (кладина оленья) ; 10 видов грибов - феллориния шишковатая, шампиньон табличный, сморчок степной и др.